你查查前后文。

因为按语法规则，「黙っておくよ」不能理解为“不要再说了”,而应该理解为:“我不再说了”。其中的「よ」凡是接在意志动词现在时后面，这个动作一般是“我”做的，而不是“你”做的，如果是你做的动作，则要用命令或请求句。比如：「黙っておけ」或「黙っておいて」之类的。

駅員：お金を持ってくるまで、学生証を預かっとくよ。

学生：すみませんけど、お願いがあるんですが。。。

駅員：なんだね。

学生：学校に知らせるのだけはやめてくれませんか。

駅員：わかった、わかった。だまっとくよ。

駅員：拿钱来之前，这个学生证就暂时替你保管了~

学生：不好意思啊，不过我有个请求

駅員：恩，什么

学生：可以替我保密吗？千万不要告诉校方啊

駅員：知道了知道了。不说就是了~

だまっとくよ个人感觉译成：不说就是了~比较合适些~

这就对了，这个「黙る」是车站工作人员的动作。意思是：“我不说”。