A给B介绍完校园之后，B说：本当に長い時間、ありがとうございます，

省略的是：占用了你那么长的时间，还是你陪了我那么长时间，（或者是表达的就是类似的意思），那么我的问题是：用日语补全了该如何表达呢？

不管是占用了你那么长时间，还是你陪了我那么长时间，最重要的是后面一句。前面只是一些客套话而已。

ほんとに長い時間を頂いて　ありがとうございます。

也可以说成：

ほんとに長い時間お邪魔しまして　ありがとうございます。